Ksyleenin tiheä hengittäminen voi aiheuttaa syöpäriskin.
Ksyleeni kuuluu syöpää aiheuttavaan luokkaan 3, mikä tarkoittaa, että pitkäaikainen kosketus voi aiheuttaa syöpäsairauksia. Lisäksi lyhyt mutta voimakas altistuminen ksyleenille voi aiheuttaa myrkyllisiä vaikutuksia.