Butadieenillä tiedetään olevan myrkyllisiä ominaisuuksia.
Hengitettäessä henkilöillä voi esiintyä päänsäryn, pahoinvoinnin ja huimauksen kaltaisia oireita. Jos butadieenia hengitetään vahingossa, on välttämätöntä poistua välittömästi lähistöltä ja hakeutua alueelle, jossa on puhdasta ilmaa.