Η συζήτηση για την τοξικότητα χωρίς αναφορά στη δόση είναι παραπλανητική- το καθαρό βουτάνιο είναι εγγενώς μη τοξικό. Ενώ το βουτάνιο δεν μεταβολίζεται στο ανθρώπινο σώμα, η συνεχής έκθεση σε υψηλά επίπεδα μπορεί να διεισδύσει στο κυκλοφορικό σύστημα, μεταβάλλοντας ενδεχομένως τις κανονικές μεταβολικές λειτουργίες.
Όταν το βουτάνιο εισπνέεται, ταξιδεύει στους πνεύμονες όπου απορροφάται και στη συνέχεια επηρεάζει τον εγκέφαλο, καταστέλλοντας το κεντρικό νευρικό σύστημα. Μικρή έκθεση μπορεί να προκαλέσει συμπτώματα όπως ζάλη, πονοκεφάλους και θολή όραση. Αντίθετα, η σημαντική έκθεση μπορεί να οδηγήσει σε απώλεια των αισθήσεων.