Diskuse o toxicitě bez ohledu na dávku je zavádějící; čistý butan je ze své podstaty netoxický. Ačkoli butan není v lidském těle metabolizován, může při trvalém vystavení vysokým koncentracím pronikat do oběhového systému a potenciálně měnit běžné metabolické funkce.
Při vdechování se butan dostává do plic, kde se vstřebává a následně působí na mozek, kde tlumí centrální nervový systém. Menší expozice může způsobit příznaky, jako jsou závratě, bolesti hlavy a rozmazané vidění. Naopak významná expozice může vést k bezvědomí.
