O tetrahidrotiofeno, reconhecido por sua toxicidade, se enquadra na categoria de produtos químicos perigosos. É propenso a se decompor em substâncias tóxicas se a temperatura de armazenamento for superior a 220°C.
Dada a considerável disparidade de solubilidade entre alcanos de cadeia linear e compostos aromáticos, as unidades de extração aromática são comumente empregadas como agentes de extração. Esses reagentes também encontram uso paralelo em ambientes laboratoriais.