Το αέριο φωσφίνη είναι γνωστό για την ακραία τοξικότητά του, την ευφλεκτότητά του και την εκρηκτικότητά του. Ο ακατάλληλος χειρισμός της απολύμανσης με φωσφίνη μπορεί εύκολα να οδηγήσει σε σημαντικούς κινδύνους για την υγεία και, σε σοβαρές περιπτώσεις, μπορεί να αποβεί μοιραίος.