Myrkyllisyydestä keskusteleminen ilman viittausta annokseen on harhaanjohtavaa; puhdas butaani on luonnostaan myrkytöntä. Vaikka butaani ei metaboloidu ihmiskehossa, jatkuva altistuminen suurille pitoisuuksille voi tunkeutua verenkiertoelimistöön, mikä saattaa muuttaa aineenvaihdunnan säännöllisiä toimintoja.
Kun butaania hengitetään sisään, se kulkeutuu keuhkoihin, jossa se imeytyy ja vaikuttaa sitten aivoihin tukahduttaen keskushermostoa. Vähäinen altistuminen voi aiheuttaa oireita, kuten huimausta, päänsärkyä ja näön hämärtymistä. Sen sijaan merkittävä altistuminen voi johtaa tajuttomuuteen.
