חשיפה ממושכת לבוטאן עלולה לגרום לתופעות רעילות. בוטאן בריכוזים גבוהים הוא חומר מחניק ומסמם, ולכן יש לפנות מיד את האזור הנגוע ולפתוח חלונות לאוורור. בליעת 20 מ"ל בוטאן עלולה לגרום להרעלה; במקרים של אובדן הכרה, יש לפנות את החולה...
בוטאן ידוע כבעל רעילות והשפעות מזיקות על בריאות האדם. בריכוזים גבוהים, בוטאן עלול לגרום לחנק ולהשפעות נרקוטיות. חשיפה אליו מתבטאת בדרך כלל בסחרחורות, כאבי ראש ונמנום, עם פוטנציאל להחמרה עד כדי תרדמת במצבים קיצוניים.
בלוני בוטאן כרוכים בסיכונים מובנים, ולכן יש להשתמש בהם הרחק ממקורות חום ובהקפדה על הנחיות השימוש הנכונות. בלוני בוטאן ניידים הם דליקים ביותר. השימוש בהם כפוף לתקנים מחמירים, כולל בדיקות דליפה לפני ההצתה בממשק ואיסור מוחלט על הטיה או היפוך.
דיון ברעילות ללא התייחסות למינון עלול להטעות; בוטאן טהור אינו רעיל מטבעו. אמנם בוטאן אינו עובר מטבוליזם בגוף האדם, אך חשיפה מתמשכת לרמות גבוהות עלולה לחדור למערכת הדם ולשנות את תפקודי חילוף החומרים הרגילים. כאשר בוטאן נשאף, הוא מגיע לריאות, שם הוא נספג ואז...
רעילות חריפה מתבטאת בעיקר בתסמינים כגון כאבי ראש, סחרחורות, ישנוניות, בחילות ומצב הדומה לשיכרון, כאשר במקרים החמורים ביותר היא עלולה לגרום לתרדמת. חשיפה כרונית עלולה לגרום לכאבי ראש מתמשכים, סחרחורות, הפרעות שינה ורגישות כללית לעייפות.