דיון ברעילות ללא התייחסות למינון עלול להטעות; בוטאן טהור אינו רעיל מטבעו. למרות שבוטאן אינו מתעכל בגוף האדם, חשיפה מתמשכת לרמות גבוהות שלו עלולה לחדור למערכת הדם ולשנות את תפקודי חילוף החומרים הרגילים.

כאשר בוטאן נשאף, הוא עובר לריאות, שם הוא נספג ומשפיע על המוח, מדכא את מערכת העצבים המרכזית. חשיפה קלה עלולה לגרום לתסמינים כמו סחרחורת, כאבי ראש וראייה מטושטשת. לעומת זאת, חשיפה משמעותית עלולה להוביל לאובדן הכרה.
