Il tetraidrotiofene, riconosciuto per la sua tossicità, rientra nella categoria delle sostanze chimiche pericolose. È soggetto a decomporsi in sostanze tossiche se la temperatura di stoccaggio supera i 220 °C.
Data la notevole disparità di solubilità tra gli alcani a catena retta e i composti aromatici, le unità di estrazione aromatiche sono comunemente utilizzate come agenti di estrazione. Tali reagenti trovano un impiego parallelo anche negli ambienti di laboratorio.