Ethylenoxid er anerkendt som et bredspektret og meget effektivt gasformigt desinfektionsmiddel, men Det udgør en betydelig risiko for menneskers sundhed og udviser toksicitetsniveauer, der overstiger dem for chloroform og tetrachlormethan.
I første omgang rammer den luftvejene og fremkalder symptomer som kvalme, opkast, diarré og smerter sammen med undertrykkelse af centralnervesystemet. I alvorlige tilfælde kan det eskalere til åndedrætsbesvær og lungeødem.