Етиленовият оксид е признат за широкоспектърен и високо ефективен газов дезинфектант, но представлява значителна вреда за човешкото здраве, тъй като има нива на токсичност, надвишаващи тези на хлороформа и въглеродния тетрахлорид.
Първоначално той се насочва към дихателните пътища, като предизвиква симптоми като гадене, повръщане, диария и болка, както и потискане на централната нервна система. В тежки случаи може да се стигне до респираторен дистрес и белодробен оток.