Etylenoxid je uznáván jako širokospektrální a vysoce účinný plynný dezinfekční prostředek, avšak představuje významné poškození lidského zdraví, protože vykazuje vyšší toxicitu než chloroform a tetrachlormethan..
Zpočátku se zaměřuje na dýchací cesty a vyvolává příznaky, jako je nevolnost, zvracení, průjem a bolest, spolu s útlumem centrálního nervového systému. V závažných případech může přerůst v respirační potíže a plicní edém.