Etylénoxid je uznávaný ako širokospektrálny a vysoko účinný plynný dezinfekčný prostriedok, ale predstavuje významné poškodenie ľudského zdravia, pretože vykazuje hodnoty toxicity prevyšujúce hodnoty chloroformu a tetrachlórmetánu.
Spočiatku sa zameriava na dýchacie cesty a vyvoláva príznaky ako nevoľnosť, vracanie, hnačka a bolesť spolu s útlmom centrálneho nervového systému. V závažných prípadoch môže prerásť do respiračnej tiesne a pľúcneho edému.