Pripažįstama, kad etileno oksidas yra plataus veikimo spektro ir labai veiksminga dujinė dezinfekavimo priemonė, tačiau jis daro didelę žalą žmonių sveikatai, nes jo toksiškumo lygis viršija chloroformo ir tetrachlormetano toksiškumo lygį.
Iš pradžių jis veikia kvėpavimo takus ir sukelia tokius simptomus kaip pykinimas, vėmimas, viduriavimas ir skausmas, taip pat slopina centrinę nervų sistemą. Sunkiais atvejais gali pasireikšti kvėpavimo sutrikimas ir plaučių edema.
