Etilen oksid je priznan kot širok spekter in zelo učinkovito plinsko razkužilo, vendar je predstavlja veliko škodo za zdravje ljudi, saj njegova toksičnost presega toksičnost kloroforma in ogljikovega tetraklorida.
Sprva je usmerjen v dihalne poti, kjer povzroča simptome, kot so slabost, bruhanje, driska in bolečina, ter zavira delovanje osrednjega živčnega sistema. V hujših primerih se lahko stopnjuje do dihalne stiske in pljučnega edema.
