Etyleenioksidi on tunnustettu laajakirjoiseksi ja erittäin tehokkaaksi kaasumaiseksi desinfiointiaineeksi. se aiheuttaa merkittävää haittaa ihmisten terveydelle, sillä sen myrkyllisyys ylittää kloroformin ja hiilitetrakloridin myrkyllisyystasot.
Aluksi se kohdistuu hengitysteihin aiheuttaen oireita, kuten pahoinvointia, oksentelua, ripulia ja kipua, sekä keskushermoston tukahduttamista. Vaikeissa tapauksissa se voi kärjistyä hengitysvaikeuksiin ja keuhkoödeemaan.
